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Bibliographie de l'Institut Maurice-Lamontagne
Claude NOZÈRES
NOZÈRES, C., 2011. Managing image data for aquatic sciences : an introduction to best practices and workflows. Can. Tech. Rep. Fish. Aquat. Sci., 2962, 183 p.
Un aperçu des technologies numériques en photo et en vidéo est présenté pour l'acquisition et la gestion des données d'imagerie dans le contexte de projets en sciences aquatiques. Les technologies pour les images fixes (photos) et la vidéo sont évaluées en fonction des pratiques courantes et des normes en matière de média, d'équipement et de flux de traitement. Des exemples de scénarios de travail employant une variété de logiciels sont fournis à titre indicatif pour améliorer la qualité des images et pour une gestion efficace des données associées.
PROVENCHER, L., C. NOZÈRES, 2011. Protocole de suivi des communautés benthiques de la zone de protection marine Manicouagan ; Monitoring plan for benthic communities of the Manicouagan Marine Protected Area. MPO, Secrétariat canadien de consultation scientifique, Document de recherche ; DFO, Canadian Science Advisory Secretariat, Research Document, 2011/051, 29 p.
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Le secteur marin au large de la péninsule de Manicouagan a été ciblé comme future zone de protection marine (ZPM) en vue de conserver et protéger cet espace maritime productif et diversifié. La Direction des Sciences du ministère des Pêches et des Océans doit fournir aux gestionnaires de cette ZPM (Direction Régionale de la Gestion des Écosystèmes) une recommandation de suivi écologique pour cette zone. La conception du suivi a été amorcée en définissant les composantes écologiques qui doivent être suivies pour vérifier l’atteinte des objectifs de conservation de la ZPM. Les composantes biotiques sélectionnées sont celles qui ont été reconnues importantes au niveau de la productivité et de la biodiversité et dites représentatives de la ZPM. Parmi ces composantes, une des plus importantes concerne les communautés benthiques, ciblées dû à leur statut de résidentes de la ZPM. Les connaissances sur ces communautés étant presque inexistantes, des campagnes d’échantillonnage ont été réalisées de 2006 à 2008 pour les caractériser et les localiser. Les résultats de ces études ont permis de délimiter quatre zones distinctes qui sont à la base du protocole de suivi développé. Vingt cinq stations y sont positionnées, dont vingt et une couvrent les deux premières zones, plus riches en diversité et productivité. Ces stations seront échantillonnées annuellement au moyen d’une benne IKU et d’imageries (photos sous-marines et vidéo). Les mesures d’abondance et de biomasse des espèces identifiées à chacune des stations permettront de faire le suivi des différents assemblages benthiques de la ZPM. À ces mesures s’ajoutent celles de variables abiotiques permettant d’évaluer le milieu de vie de ces communautés et d’apporter un support à l’interprétation des indicateurs de performance.
KENNEDY, M.K., C. NOZÈRES, R. MILLER, B. VANHOORNE, W. APPELTANS, 2011. The Canadian Register of Marine Species photo gallery : a user's guide, version 1. Can. Tech. Rep. Fish. Aquat. Sci., 2933, 52 p.
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Le portail canadien du registre mondial d’espèces marines (WoRMS) héberge des informations taxonomiques spécifiques aux régions aquatiques du Canada. Des photos fournies par des utilisateurs complémentent les informations taxonomiques de différentes régions du Canada en permettant à d'autres utilisateurs de voir des images numériques des espèces. Les images sont aussi consultées par des registres partenaires et autres portails d’espèces du monde. Ce guide aide les utilisateurs à préparer les images et leurs données associées avant de les téléverser vers la galerie de photos, aidant à ce que les noms d’espèces soient exacts et que les auteurs soient identifiés et facilitant la découverte et la recherche des informations taxonomiques à partir de cette ressource publique dans internet.
MARK, S., L. PROVENCHER, E. ALBERT, C. NOZERES, 2010. Cadre de suivi écologique de la zone de protection marine Manicouagan (Québec) : bilan des connaissances et identification des composantes écologiques à suivre. Rapp. tech. can. sci. halieut. aquat., 2914, 135 p.
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Le secteur marin au large de la péninsule de Manicouagan a été ciblé comme future zone de protection marine (ZPM) en vue de conserver et protéger cet espace marin productif et diversifié. Dans le cadre du programme Santé des Océans, la Direction régionale des sciences du ministère des Pêches et des Océans doit fournir aux gestionnaires des ZPM (Direction régionale des océans, de l’habitat et des espèces en péril) une recommandation de suivi écologique pour chacune des ZPM. Le développement d’un suivi écologique comprend trois étapes : dresser le portrait de la zone, concevoir le suivi et, enfin, le réaliser. Le présent document traite des deux premières étapes en dressant le portrait de l’écosystème de la ZPM Manicouagan à partir des connaissances disponibles et en ciblant les composantes écologiques à suivre pour évaluer l’atteinte des objectifs de conservation de la ZPM. Deux groupes de composantes ont été sélectionnés : 1) celui des composantes dites représentatives de la ZPM qui permettront d’évaluer la performance de la ZPM dans l’atteinte des objectifs de conservation et 2) celui des composantes qui permettront un suivi de l’état global de l’écosystème de la ZPM et apporteront un support à l’interprétation des indicateurs de performance.
NOZERES, C., D. ARCHAMBAULT, P.-M. CHOUINARD, J. GAUTHIER, R. MILLER, E. PARENT, P. SCHWAB, L. SAVARD, J.-D. DUTIL, 2010. Guide d'identification des poissons marins de l'estuaire et du nord du golfe du Saint-Laurent et protocoles suivis pour leur échantillonnage lors des releves par chalut entre 2004 et 2008 ; Identification guide for marine fishes of the estuary and northern Gulf of St. Lawrence and sampling protocols used during trawl surveys between 2004 and 2008. Can. Tech. Rep. Fish. Aquat. Sci., 2866, 168 p.
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Le relevé annuel réalisé par les scientifiques du Ministère des Pêches et des Océans à bord de grands chalutiers est une source importante d’information sur l’état des ressources marines exploitées de l’estuaire et du nord du golfe du Saint-Laurent. L’objectif principal du relevé est l’estimation de l’abondance et de la biomasse de cinq espèces importantes commercialement, soit la morue franche (Gadus morhua), le flétan du Groenland (Reinhardtius hippoglossoides), les sébastes acadien (Sebastes fasciatus</i) et atlantique (Sebastes mentella), et la crevette nordique (Pandalus borealis). Depuis quelques années, les biologistes cherchent à mieux intégrer l’information sur l’état des stocks et de l’écosystème, ce qui a nécessité un effort accru pour mieux décrire la capture des autres espèces de poissons et des invertébrés. Le protocole d’observation et d’échantillonnage qui a longtemps prévalu a donc graduellement évolué en un protocole nettement plus détaillé et complexe. La mise en application de ce protocole s’est toutefois heurtée à la difficulté de bien identifier les dizaines d’espèces capturées à chaque station de chalutage. Le présent rapport fournit un guide d’identification des espèces de poisson susceptibles d’être capturées lors des relevés dans l’estuaire et le nord du golfe du Saint-Laurent. Ce guide visuel devrait s'avérer un outil pratique pour former le personnel et assurer la qualité des données recueillies. Ce rapport décrit également le protocole d’observation et d’échantillonnage de la capture de poissons qui a été suivi lors des relevés à bord du NGCC Teleost entre 2004 et 2008 et présente sommairement une analyse descriptive des captures de poissons au cours de cette même période.
DUTIL, J.-D., C. NOZÈRES, P.-M. SCALLON-CHOUINARD, L. VAN GUELPEN, D. BERNIER, S. PROULX, R. MILLER, C. SAVENKOFF, 2009. Poissons connus et méconnus des fonds marins du Saint-Laurent. Naturaliste can., 133(2): 70-82.
Des relevés effectués au moyen de chaluts benthiques entre 2004 et 2008 dans le bas Saguenay, l'estuaire maritime et le nord du golfe du Saint-Laurent ont permis d'identifier à l'espèce plus d'un million de poissons. Les captures ont été largement dominées par quatre espèces de prédateurs d'intérêt commercial: le flétan du Groenland, deux espèces de sébaste et la morue franche, mais on a dénombré plus d'une centaine d'espèces dont la moitié peuvent être considérées rares sur les fonds chalutés. Les espèces les plus abondantes dans les captures étaient également celles qui furent répertoriées dans une plus forte proportion des stations échantillonnées. Les espèces inusitées possèdent une distribution soit boréale, soit méridionale, et fréquentent généralement le plateau continental ou même le talus continental au-dessus de la plaine abyssale dans l'Atlantique. Les données issues de ces relevés ne fournissent qu'une vision partielle des communautés de poissons dans le Saint-Laurent: les poissons pélagiques et estuariens étaient mal représentés dans nos échantillons, les fonds rocheux ou escarpés n'étant généralement pas chalutables. Ce vaste territoire d'environ I5O 000 km2 est peuplé d'une faune variée.©2009 La Société Provancher d'histoire naturelle du Canada Certains poissons sont communs, d'autres représentent des visiteurs occasionnels en provenance des profondeurs de l'Atlantique, mais tous sont fascinants. Encore aujourd'hui, l'écologie d'un grand nombre de ces espèces reste mal connue.
DAIGLE, D., C. NOZÈRES, H. BENOÎT, 2006. A rapid reference guide for the identification and sampling at-sea of marine fishes captured during commercial fishing activities. Can. Manuscr. Rep. Fish. Aquat. Sci., 2744E, 25 p.
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Le présent guide abondamment illustré se veut un document de référence rapide pour les observateurs des pêches et d’autres membres du personnel travaillant à bord des bateaux de pêche commerciale dans le Sud du golfe du Saint-Laurent (division 4T de l’OPANO). Il a pour but de faciliter l’identification des espèces de poisson les plus communément observées par le personnel travaillant sur le terrain pendant les sorties de pêche commerciale grâce aux photos et aux principaux caractères morphologiques fournis. Bien qu’il ne soit pas destiné à remplacer les clés et les descriptions taxonomiques plus détaillées, ce guide pratique devrait se révéler utile pour le travail en mer, où les conditions ne sont pas propices à une consultation de sources documentaires plus exhaustives. On y retrouve également une description sommaire, photos à l’appui, des techniques d’échantillonnage de poissons en mer.
DUTIL, J.-D., R. MILLER, C. NOZÈRES, B. BERNIER, D. BERNIER, D. GASCON, 2006. Révision des identifications de poissons faites lors des relevés scientifiques annuels de l'abondance des poissons de fond et de la crevette nordique dans l'estuaire et le nord du golfe du Saint-Laurent. Rapp. manus. can. sci. halieut. aquat., 2760, 87 p.
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Les séries temporelles de données sont une source d’information précieuse pour mettre en perspective la situation présente. Les données issues des relevés scientifiques annuels d'évaluation de l'abondance du poisson de fond et de la crevette nordique dans l'estuaire et le nord du golfe du Saint-Laurent sont régulièrement utilisées à cette fin. Si la validité des données n’est pas mise en doute en ce qui concerne l’identification des espèces commerciales sous mandat de gestion dans notre région, il en va autrement des données sur l’identification des autres espèces de poissons. Suite à un atelier tenu à l’IML en 2005, un groupe de travail a évalué dans quelle mesure les identifications des espèces non commerciales ou des espèces ne faisant pas l’objet d’un mandat régional et récoltées entre 1978 et 2003 sont valides. Dans le cas de ces espèces, le protocole d’échantillonnage a varié d’une année à l’autre. Tous les poissons n’ont pas été identifiés à l’espèce. Certaines captures n’ont été identifiées qu’à des niveaux taxonomiques très généraux. L’identification de certaines espèces a été inadéquate, notamment chez les Cottidae, les Liparidae et les Zoarcidae. Il ressort de cet examen que la base de données relationnelle doit être utilisée avec prudence si l’on s’intéresse aux espèces rares, à mesurer la biodiversité, ou à étudier les tendances temporelles dans le cas des espèces qui ne sont pas sous le mandat de gestion de la région du Québec. Dans ce rapport, nous identifions les cas problèmes et suggérons des solutions pour améliorer la qualité des données historiques et le processus d’acquisition de nouvelles données.
DAIGLE, D., C. NOZÈRES, H. BENOÎT, 2006. Guide de référence rapide pour l'échantillonnage et l'identification d'espèces marines capturées durant la pêche commerciale en mer. Rapp. manus. can. sci. halieut. aquat., 2744F, 25 p.
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Le présent guide abondamment illustré se veut un document de référence rapide pour les observateurs des pêches et d’autres membres du personnel travaillant à bord des bateaux de pêche commerciale dans le Sud du golfe du Saint-Laurent (division 4T de l’OPANO). Il a pour but de faciliter l’identification des espèces de poisson les plus communément observées par le personnel travaillant sur le terrain pendant les sorties de pêche commerciale grâce aux photos et aux principaux caractères morphologiques fournis. Bien qu’il ne soit pas destiné à remplacer les clés et les descriptions taxonomiques plus détaillées, ce guide pratique devrait se révéler utile pour le travail en mer, où les conditions ne sont pas propices à une consultation de sources documentaires plus exhaustives. On y retrouve également une description sommaire, photos à l’appui, des techniques d’échantillonnage de poissons en mer.
NOZÈRES, C., M. BÉRUBÉ, V. HAEBERLE, R. MILLER, F. PROUST, 2003. Marine species identification guide for the St. Lawrence. DFO, Maurice-Lamontagne Institute, CD-ROM.
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Depuis la ratification par le Canada de la Convention des Nations Unies sur la diversité biologique en 1992, différentes initiatives pour découvrir et évaluer les richesses marines ont mis en lumière le besoin d'avoir davantage d'information sur les espèces moins connues. Le ministère des Pêches et des Océans (MPO) fait sa part en profitant de toutes les occasions possibles pour documenter la biodiversité marine. Cependant, en mission, le temps est précieux, et les scientifiques peuvent être confrontés à la tâche intimidante d'identifier rapidement plusieurs espèces, dont certaines sont rarement capturées par les engins de pêche réguliers. Afin de parfaire l'identification spécifique lors des missions scientifiques ou des observations en mer, l'équipe des espèces en péril du MPO région du Québec à l'Institut Maurice-Lamontagne a produit un outil de terrain bilingue sur les espèces marines de poissons et d'invertébrés que l'on retrouve dans l'estuaire et le nord du golfe du Saint-Laurent.
NOZÈRES, C., M. BÉRUBÉ, V. HAEBERLE, R. MILLER, F. PROUST, 2003. Guide d'identification d'espèces marines du Saint-Laurent. MPO, Institut Maurice-Lamontagne, CD-ROM .
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Depuis la ratification par le Canada de la Convention des Nations Unies sur la diversité biologique en 1992, différentes initiatives pour découvrir et évaluer les richesses marines ont mis en lumière le besoin d'avoir davantage d'information sur les espèces moins connues. Le ministère des Pêches et des Océans (MPO) fait sa part en profitant de toutes les occasions possibles pour documenter la biodiversité marine. Cependant, en mission, le temps est précieux, et les scientifiques peuvent être confrontés à la tâche intimidante d'identifier rapidement plusieurs espèces, dont certaines sont rarement capturées par les engins de pêche réguliers. Afin de parfaire l'identification spécifique lors des missions scientifiques ou des observations en mer, l'équipe des espèces en péril du MPO région du Québec à l'Institut Maurice-Lamontagne a produit un outil de terrain bilingue sur les espèces marines de poissons et d'invertébrés que l'on retrouve dans l'estuaire et le nord du golfe du Saint-Laurent.
