Bibliographie de l'Institut Maurice-Lamontagne

Chris W. McKINDSEY

GAGNON, K., C.W. McKINDSEY, L.E. JOHNSON, 2011. Dispersal potential of invasive algae : the determinants of buoyancy in Codium fragile ssp.fragile. Mar. Biol., 158(11): 2449-2458.

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The capacity for long-distance dispersal is an important factor in determining the spread of invasive species. For algae, positive buoyancy generally is correlated with increased dispersal potential, and the light environment has been previously identified as a possible determinant of buoyancy in several species. We examined the effect of light intensity on the buoyancy of fragments of the invasive Green Alga Codium fragile ssp. fragile. Under natural and controlled conditions, the buoyancy of samples taken from the thallus tip was higher than those from near the holdfast. Both laboratory and field experiments also showed that buoyancy was dynamic and switched from positive to negative under reduced light intensity, but this change required several days. We also observed seasonal changes in buoyancy, presumably due to natural variations in light intensity, with the buoyancy of fragments washed up on the shore highest in mid-summer. These results show that buoyancy is a dynamic property of the C. fragile ssp. fragile thallus and suggest that buoyant fragments contribute to long-range dispersal and accelerated regional spread of this invader. This finding suggests that dispersal is more likely during conditions of high light intensity and illustrates the need to understand how variations in the natural environment can affect the dispersal potential of invasive species.©2011 Springer

DROUIN, A., C.W. MCKINDSEY, L.E. JOHNSON, 2011. Detecting the impacts of notorious invaders : experiments versus observations in the invasion of eelgrass meadows by the green seaweed Codium fragile. Oecologia, X: XX-XX (Article in press).

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Biological invasions can vary in the extent of their effects on indigenous communities but predicting impacts for particular systems remains difficult. In coastal marine ecosystems, the green seaweed Codium fragile ssp. Fragile is a notorious invader with its reputation based on studies conducted largely on rocky shores. The green seaweed has recently invaded soft-bottom eelgrass communities by attaching epiphytically to eelgrass (Zostera marina) rhizomes, thereby creating the potential for disruption of these coastal habitats through competition or disturbance. We investigated the effect of this invader on various aspects of eelgrass performance (shoot density and length, shoot growth, above- and below-ground biomass, carbohydrate storage) using both small-scale manipulative and large-scale observational experiments. Manipulative experiments that varied Codium abundance demonstrated clear negative effects over a 4-month period on shoot density and carbohydrate reserves, but only for high, but realistic, Codium biomass levels. Light levels were much lower under canopies for high and medium density Codium treatments relative to low and control Codium cover treatments, suggesting that shading may influence eelgrass growing under the algal cover. In contrast, these effects were either not detectable or very weak when examined correlatively with field surveys conducted at larger spatial scales, even for sites that had been invaded for over 4 years. It is premature to extend generalizations of Codium’s impact derived from studies in other systems to eelgrass communities; further efforts are required to assess the long-term threats that the alga poses to this ecosystem. This study demonstrates the need to investigate impacts of invasions over multiple scales, especially those that incorporate the temporal and spatial heterogeneity of the invader’s abundance.©2011 Springer

OLIVIER, F., C. GRANT, G. SAN MARTIN, P. ARCHAMBAULT, C.W. MCKINDSEY, 2011. Syllidae (Annelida : Polychaeta : Phyllodocida) from the Chausey Archipelago (English Channel, France), with a description of two new species of the Exogoninae Prosphaerosyllis. Marine Biodiversity, art. no D06204, 9 p.

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Specimens of Syllidae (Polychaeta) were collected from a coarse sediment habitat in the intertidal zone of the Chausey Archipelago (English Channel, France). Twenty-one species of Syllidae were identified in this zone, including two new species, which are described herein. Prosphaerosyllis chauseyensis, n. sp. Is characterized by a distinct digitiform papilla on antennae, tentacular and dorsal cirri, and by the presence of two sizes of dermal papillae without any specific arrangement. Prosphaerosyllis laubieri, n. sp. Is a minute sized species with dorsal cirri similar throughout the body and with small, scattered papillae on the dorsum and ventrum, which are longer and numerous on the palps. One species was reported for the first time in the north-east Atlantic (Parapionosyllis brevicirra) and six were new for both France and the English Channel (Prosphaerosyllis giandoi, Sphaerosyllis glandulata, Sphaerosyllis taylori, Streptosyllis campoyi, Syllis licheri, and Syllis pontxioi).©2011 Springer

DROUIN, A., C.W. MCKINDSEY, L.E. JOHNSON, 2011. Higher abundance and diversity in faunal assemblages with the invasion of Codium fragile ssp. Fragile in eelgrass meadows. Mar. Ecol. Prog. Ser., 424: 105-117.

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The present study examined how species-specific attributes of the invasive alga Codium fragile ssp. Fragile (hereafter Codium) and eelgrass Zostera marina influenced faunal assemblages associated with eelgrass ecosystems in îles de la Madeleine, eastern Canada. Direct association of species with Codium (<1 m) was evaluated and compared to eelgrass faunal assemblages from invaded beds. Potential neighborhood effects (ca. 10 m) were assessed by comparing invertebrates associated with eelgrass in invaded and non-invaded beds. The influence of Codium on more mobile species was evaluated by comparing fish assemblages associated with macrophytes in invaded and non-invaded beds. In addition, species–area relationships for low mobility species associated with Codium were contrasted between beds where Codium or eelgrass was the dominant structuring macrophyte. Codium had distinct invertebrate species assemblages, as there was a greater abundance and diversity of invertebrates associated with Codium than with eelgrass, and multivariate assemblage structure differed between macrophyte types. In contrast, no neighborhood patterns were observed as invertebrate assemblages associated with eelgrass did not differ between invaded and non-invaded beds, suggesting that the mechanisms that account for differences between the invertebrate assemblages are a function of the macrophyte’s nature and operate at small spatial scales. Fish community structure differed between invaded and non-invaded beds, largely due to a greater abundance of 2 fishes, Apeltes quadracus and Tautogolabrus adspersus, in invaded beds. Epifaunal abundance and species richness were positively correlated with Codium thallus biomass, and the abundance relative to biomass correlation was greatest where Codium was the dominant macrophyte. Experimental manipulation of thallus structure to create straight or branched Codium fronds with similar surface area showed that associated invertebrate and gastropod abundance was not influenced by this factor and indicated that factors other than macrostructure complexity influenced the presence of epifauna on the introduced alga. Overall, the present study suggests that the invasion of eelgrass beds by Codium increases faunal density and diversity. However, longer-term effects of Codium invasion in this and other eelgrass ecosystems require further assessment, as the severity of the invasion effects on faunal communities likely depends on the interaction between Codium and eelgrass.©2011 Inter-Research

MCKINDSEY, C.W., P. ARCHAMBAULT, M.D. CALLIER, F. OLIVIER, 2011. Influence of suspended and off-bottom mussel culture on the sea bottom and benthic habitats : a review. Can. J. Zool., 89(7): 622-646.

LÉVESQUE, M., P. ARCHAMBAULT, C.W. McKINDSEY, S. VAZ, D. ARCHAMBAULT, 2010. Predictive benthic habitat suitability model for the Estuary and northern Gulf of St. Lawrence (2006). Can. Tech. Rep. Fish. Aquat. Sci., 2893, 27 p.

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Les analyses de cette étude se basent essentiellement sur l’utilisation des techniques de géostatistiques et des modèles linéaires généralisés (GLM). L’objectif principal est ainsi de prédire les habitats potentiels des communautés de la macrofaune benthique de l’Estuaire et du nord du Golfe du Saint-Laurent, en fonction des paramètres environnementaux étudiés, pour l’année 2006. L’équation résultante de la modélisation a ainsi retenue l’oxygène dissous, la profondeur, la température et le courant de fond afin d’expliquer près de 40 % de la variation des communautés benthiques présentes. L’analyse de l’équation de prédiction résultante, permet ainsi de mettre en évidence les zones à fort et faible potentiel de la présence de communautés benthique spécifique, mis en évidence par l’application d’analyse canonique. Cette étude a ainsi permis de mettre sur pied une base de données primaire d’informations relatives aux habitats benthiques ainsi que sur les paramètres physiques qui s’y retrouvent. Une mise à jour annuelle de cette base de données pourra donc être effectuée suite aux missions multispécifiques.

LEGGATT, R.A., P.T. O'REILLY, P.J. BLANCHFIELD, C.W. MCKINDSEY, R.H.DEVLIN, 2010. Pathway of effects of escaped aquaculture organisms or their reproductive material on natural ecosystems in Canada ; Séquence des effets liés aux organismes d’élevage évadés ou à leur matériel de reproduction sur les écosystèmes naturels au Canada. DFO, Canadian Science Advisory Secretariat, Research Document ; MPO, Secrétariat canadien de consultation scientifique, Document de recherche, 2010/019, 76 p.

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L’objectif du présent document est de fournir un aperçu des séquences des effets des poissons d’élevage évadés (particulièrement les poissons à nageoires et les bivalves) sur les écosystèmes naturels au Canada. On a remarqué dans de nombreuses régions du Canada l’évasion, la survie, la dispersion et la reproduction d’organismes d’élevage, bien que l’étendue des évasions au Canada ne soit pas connue. En général, les poissons évadés ont de faibles capacités de survie, de recherche de nourriture et de reproduction par rapport à leurs congénères sauvages. Cependant, on dispose de suffisamment de preuves pour montrer que le saumon atlantique évadé peut avoir des effets sur ses congénères sauvages au moyen de la compétition entre les juvéniles entraînant une baisse de la productivité chez les juvéniles sauvages et au moyen de l’hybridation entraînant le transfert partiel des phénotypes d’élevage vers les populations sauvages. Cependant, la possibilité que les poissons évadés aient des effets sur les populations sauvages en raison de la prédation, de la compétition maritime, de l’interférence reproductive et des séquences de transfert de maladies n’a pas fait l’objet de nombreuses études. De plus, dans le cas d’autres espèces évadées, il existe un degré élevé d’incertitude quant aux autres espèces évadées (p. ex. poissons de mer, autres salmonidés) en raison de preuves insuffisantes et du caractère incertain des prédictions dérivées des données existantes concernant d’autres espèces et écosystèmes. En ce qui concerne les mollusques et crustacés, des données provenant de l’extérieur du Canada indiquent que les évasions de bivalves d’élevage peuvent causer des perturbations écologiques dans les écosystèmes où elles ne sont pas des espèces indigènes. On s’attend à ce que les effets soient très particuliers au contexte et pourraient être influencés par la santé du milieu récepteur, la géographie, l’espèce et les types de souche, le climat, les étapes du cycle de vie des espèces évadées, entre autres. Dans l’ensemble, il est fort probable que les organismes d’élevage évadés aient une incidence sur les écosystèmes naturels au Canada et que cette possibilité puisse être influencée par de nombreux facteurs environnementaux et génétiques. Cependant, les effets que les poissons évadés pourraient avoir sur l’ensemble de la dynamique communautaire ou la fonction de l’écosystème ne sont pas encore connus.

WEISE, A.M., C.J. CROMEY, M.D. CALLIER, P. ARCHAMBAULT, J. CHAMBERLAIN, C.W. McKINDSEY, 2009. Shellfish-DEPOMOD : modelling the biodeposition from suspended shellfish aquaculture and assessing benthic effects. Aquaculture, 288(3-4): 239-253.

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By predicting the dispersal of particulate aquaculture wastes around farm sites, numerical modelling can provide an effective tool to assess the spatial extent of environmental effects. The present paper describes how the aquaculture waste model DEPOMOD (Cromey, C.J., Nickell, T.D., Black, K.D. 2002a. DEPOMOD – modelling the deposition and biological effects of waste solids from marine cage farms. Aquaculture 214, 211-239.), originally developed for finfish aquaculture sites, was adapted and validated for suspended shellfish aquaculture. Field data were collected for species-specific model input parameters (mussel biodeposition rates and particle settling velocities) and several finfish model parameters (farm representation and calculation of aquaculture wastes) were adjusted for the shellfish scenario. Shellfish-DEPOMOD was tested at three coastal mussel Mytilus edulis farms with differing hydrodynamic regimes in Quebec, Canada. For each site, model predictions were compared to observed deposition measured in situ with sediment traps. Sedimentation rates under the three mussel culture sites were ca. Two to five times those observed at corresponding reference sites. Mussel biodeposits were predicted to accumulate within 30 m of the farms in the shallow depositional sites while being dispersed more than 90 m in the deeper dispersive site. At the farm site in Great-Entry Lagoon, model predictions agreed well with field data for the 0+ and 1+ mussel cohorts when the maximum biodeposit production parameter was used. At the farm site in House-Harbour Lagoon, model predictions did not agree with observed sedimentation rates, due most likely to the resuspension and advection of non farm-derived material and complex hydrodynamics. The model correctly predicted the pattern of waste dispersal at the third farm site in Cascapedia Bay, although it underestimated biodeposition. Predicted fluxes may have been underestimated at this site because biodeposits from biofouling communities were not included in the calculation of aquaculture wastes. The relationship between modelled long-term biodeposition and benthic descriptors was assessed for the three farms. Alterations to the benthic community were observed at high biodeposition rates (>15 g m^-2d^-1). At the most disturbed site, predicted fluxes were best correlated with the Infaunal Trophic Index (ITI) (R=-0.79, P<0.001), followed by AZTI's marine disturbance index (AMBI) (R=0.64, Pb0.001). The potential application of Shellfish-DEPOMOD in terms of the management of shellfish aquaculture sites is discussed.©2008 Elsevier B.V.

CALLIER, M.D., M. RICHARD, C.W. McKINDSEY, 2009. Responses of benthic macrofauna and biogeochemical fluxes to various levels of mussel biodeposition : an in situ "benthocosm" experiment. Mar. Pollut. Bull., 58(10): 1544-1553.

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An in situ experiment was done to evaluate the dose-dependent response of mussel biodeposition on benthic communities and biogeochemical fluxes. Natural benthic communities were exposed to 7 different levels of mussel biodeposition (equivalent to that produced by 0–764 mussels m^-2) over 50 days. Benthic communities responded as predicted from the Pearson, T.H., Rosenberg, R., 1978. Macrobenthic succession in relation to organic enrichment and pollution of the marine environment. Oceanogr. Mar. Biol. Annu. Rev. 16, 229–311 model of organic enrichment. Total abundance and species richness decreased with increasing biodeposition. The abundance and biomass of opportunistic species (Capitella spp.) increased in the mesocosms subject to the greatest biodeposition. Sensitive species Tellina agilis and Pherusa plumosa tended to decrease in abundance and biomass with increasing biodeposition. The biotic index M-AMBI responded clearly to increased biodeposition and may be a useful tool for assessing the effect of mussel biodeposition on the benthic environment. These results are important for the construction of predictive models for determining environmental carrying capacity for bivalve aquaculture. Crown Copyright ©2009 Published by Elsevier Ltd.

McKINDSEY, C.W., M. LECUONA, M. HUOT, A.M. WEISE, 2009. Biodeposit production and benthic loading by farmed mussels and associated tunicate epifauna in Prince Edward Island. Aquaculture, 295(1-2): 44-51.

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An experimental study was done to evaluate the biodeposition dynamics associated with mussels and two fouling tunicates, Ciona intestinalis and Styela clava, in mussel aquaculture in Prince Edward Island (PEI), eastern Canada. The presence of C. intestinalis on small constructed mussel socks increased biodeposition by a factor of about 2 relative to mussel socks without tunicates. S. clava were small and had a negligible effect on total biodeposition from mussel socks although they increased sedimentation rates relative to that of abiotic control socks. Sinking rates of faecal pellets from large C. intestinalis varied between 1.39 and 6.54 cm s^{- 1} (LSMean = 2.35 cm s^{- 1}). Using biodeposit production and sinking rates and hydrological data obtained in the present study, footprints of benthic loading due to mussel and tunicate biodeposition for a typical mussel farm in PEI were modelled using Shellfish-DEPOMOD. The results show benthic loading below longlines with C. intestinalis to be ca. 2 times greater than those from lines with only mussels with rates of up to 15.2 g m^{- 2} d^{- 1}. However, given the greater settling rate of C. intestinalis biodeposits relative to mussel biodeposits, the extent of the footprint (≥ 1 g m^{- 2} d^{- 1}) is similar or even more restrained. Crown Copyright ©2009 Elsevier B.V.

SMITH, G.K., F. GUICHARD, F. PETROVIC, C.W. McKINDSEY, 2009. Using spatial statistics to infer scales of demographic connectivity between populations of the blue mussel, Mytilus spp.. Limnol. Oceanogr., 54(3): 970-977.

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We conducted a large-scale survey of blue mussel (Mytilus spp.) populations and recruitment along 100 km of the Southern shore of the St. Lawrence Estuary, Québec, Canada. By taking advantage of the residual downstream current of our study system, we used cross-covariance analysis to test the hypothesis that postrecruitment and larval supply processes result in a positive relationship between local adult abundance and recruitment. We found no evidence of within-site correlation between adults and recruits. Alternatively, we hypothesized that demographic connectivity between populations would result in a positive covariance between adult abundance and recruitment at downstream sites separated by the average dispersal distance. We observed significant positive cross-covariance between sites separated by 12–18 km and 24–30 km. These results provide the first direct quantification of demographic connectivity between adult production and larval recruitment of Mytilus using simple survey data. The approach developed here measures connectivity over ecological time scales, and thus may be used to monitor temporal fluctuations in dispersal patterns.©2009 American Society of Limnology and Oceanography, Inc.

CALLIER, M.D., C.W. McKINDSEY, G. DESROSIERS, 2008. Evaluation of indicators used to detect mussel farm influence on the benthos : two case studies in the Magdalen Islands, Eastern Canada. Aquaculture, 278(1-4): 77-88.

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The aim of this study was to identify appropriate indicators to determine the influence of mussel aquaculture on the benthic environment. Both sediment [particle size, sediment profile imaging (SPI), % OM] and benthic community (abundance, biomass, number of species, Margalef’s species richness, Shannon-Weiner diversity, Pielou’s eveness, individual body mass, trophic group, a biotic index — AMBI, and community structure) characteristics were evaluated at two mussel farms in Great-Entry (GE) and Havre-aux-Maisons (HAM) lagoons in the Magdalen Islands (Quebec, Canada). Sampling stations were positioned directly beneath the outer-most mussel lines (0 m) and at distances of 3, 6, 9, 15, 30 m and at a control site (at either 300 or 500 m) along a transect leading from each farm. Contrasting patterns were observed. At GE, sediment characteristics and benthic communities did not vary among stations and were characterized by low diversity, abundance and biomass. At HAM, % OM decreased and macrofaunal diversity and abundance increased with increasing distance from the farm. Biomass was low under the mussel line, increased between 3 and 30 m and was low again at 300 m. This was explained by the abundance of the polychaete Pectinaria granulata, which seems to have benefited from a moderate organic loading associated with the mussel farm. The mean individual biomass of the second-order opportunistic deposit feeders P. granulata and Heteromastus filiformis decreased with distance from the farm, whereas that of the pollution-sensitive suspension feeder Ensis directus and deposit feeder Tellina agilis increased with increasing distance from the farm. At HAM, the effects of mussel farming were restricted to the vicinity of the farm, while at GE the pattern was less clear. The GE mussel farm had either little effect on the local environment or else larger-scale but diffuse effects. The study showed that the a priori choice of the sampling stations and indicators may influence the interpretation of the results. Community structure and SPI were the most efficient indices for detecting both small- and broader-scale influences at both studied mussel farms.©2008 Elsevier B.V.

THERRIAULT, T.W., L.-M. HERBORG, A. LOCKE, C.W. MCKINDSEY, 2008. Risk Assessment for European green crab (Carcinus maenas) in Canadian Waters ; Évaluation des risques représentés par le crabe européen (Carcinus maenas) dans les eaux canadiennes. DFO, Canadian Science Advisory Secretariat, Research Document ; MPO, Secrétariat canadien de consultation scientifique, Document de recherche, 2008/042, 44 p.

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Les espèces non indigènes continuent de se disperser dans de nouveaux environnements et il est important que les gestionnaires comprennent le risque potentiel qu’elles représentent. L’invasion du crabe européen (Carcinus maenas) a commencé il y a déjà plus d’un siècle en Amérique du Nord. Une évaluation formelle du risque a été entreprise en vue de déterminer le risque potentiel que représente cette espèce de crabe non indigène dans les eaux canadiennes, sur les côtes atlantique et pacifique. Les introductions les plus massives de crabe sont dues à la navigation commerciale. La présence du crabe européen dans les eaux des deux côtes qui bordent le Canada est attribuée à des activités humaines. Compte tenu des répercussions qu’a eues l’arrivée du crabe européen dans d’autres régions du fait des fortes tendances envahissantes de cette espèce, on s’inquiète beaucoup des conséquences écologiques (biologique, habitat) et génétiques que sa propagation potentielle pourrait avoir au Canada. Les caractéristiques de l’évolution biologique du crabe européen renforcent sa dispersion naturelle sur de longues distances. Il est probable que la dispersion se fait également par les eaux de ballast, mais il existe plusieurs autres vecteurs de dispersion anthropiques. Pêches et Océans Canada a procédé à une étude nationale afin de déterminer le risque potentiel que représente le crabe européen au Canada. Cette étude comportait notamment l’évaluation de la probabilité de l’arrivée, de la survie, de la reproduction et de la propagation, ainsi que des conséquences possibles, en vue d’estimer le niveau de risque. Elle a également déterminé le risque que pourraient poser les agents pathogènes, les parasites et les organismes associés (c’est-à-dire d’autres espèces envahissantes) du crabe européen. Tous ces éléments ont été évalués pendant un atelier d’experts, revu par des pairs, qui s’est tenu en février 2008. Les participants ont utilisé à cette fin la meilleure information disponible sur les aspects biologiques, les vecteurs potentiels pour l’introduction et les répercussions dans les aires de répartition, naturelles et autres. La conclusion de cette étude est que le crabe européen pose en général un risque moyen à élevé sur les deux côtes, selon l’effet écologique évalué. Les risques liés aux agents pathogènes, aux parasites et aux organismes associés ont été jugés faibles. Cependant, dans la mesure où on connaît très mal la plupart des agents pathogènes, parasites et organismes associés du crabe européen, le niveau d’incertitude est très élevé.

THERRIAULT, T.W., L.-M. HERBORG, A. LOCKE, C.W. McKINDSEY, 2008. Risk Assessment for Chinese mitten crab (Eriocheir sinensis) in Canadian Waters ; Évaluation du risque posé par le crabe chinois à mitaine (Eriocheir sinensis) dans les eaux canadiennes. DFO, Canadian Science Advisory Secretariat, Research Document ; MPO, Secrétariat canadien de consultation scientifique, Document de recherche, 2008/041, 37 p.

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Des espèces non indigènes continuent à s’étendre progressivement dans de nouveaux environnements comme c’est le cas, depuis quelques dizaines d’années, pour le crabe chinois à mitaine (Eriocheir sinensis) qui s’introduit notamment sur la côte est de l’Amérique du Nord. Une évaluation du risque a été entreprise afin de déterminer le risque éventuel que pose le crabe chinois à mitaine dans les eaux canadiennes, y compris les côtes de l’Atlantique et du Pacifique (et les plans d’eau intérieure adjacents). Si l’introduction de crabes à mitaine n’a pas été faite intentionnellement (p. ex., comme source alimentaire), on l’attribue en général aux activités de navigation commerciale. On a rapporté la présence du crabe chinois à mitaine en plusieurs endroits dans l’Est du Canada, mais l’étendue de l’invasion n’est pas bien définie. En se fondant sur les effets de la présence du crabe chinois à mitaine ailleurs, et des espèces non indigènes en général, les effets possibles sur le plan biologique, génétique et sur l’habitat semblent plutôt préoccupants si cette espèce s’établit et s’étend au Canada. Les caractéristiques du cycle biologique du crabe chinois à mitaine pourraient favoriser une expansion naturelle sur de longues distances et une plus grande dispersion par les eaux de ballast est envisageable, mais il existe un certain nombre d’autres vecteurs possibles. Pêches et Océans Canada a réalisé une évaluation du risque à l’échelle nationale afin de déterminer le risque éventuel posé par cette espèce de crabe non indigène au Canada. L’évaluation cherchait à établir la probabilité d’arrivée, de survie, de reproduction et de dispersion, de même que les conséquences associées, en guise de mesure du risque. En outre, le risque posé par les éventuels agents pathogènes, parasites ou compagnons de route (p. ex., d’autres espèces envahissantes) a été évalué advenant que le crabe chinois à mitaine soit introduit dans les eaux canadiennes. Ces éléments ont fait l’objet d’une évaluation par des pairs se composant d’experts du domaine dans le cadre d’un atelier tenu en février 2008, au moyen de la plus récente information disponible sur les vecteurs biologiques potentiels d’introduction, et les effets chez les spécimens indigènes et introduits de crabe chinois à mitaine. L’évaluation a permis de conclure que le crabe chinois à mitaine posait généralement un risque moyen pour les deux régions côtières bien que les effets sur l’habitat, notamment l’érosion des rives, étaient jugés à plus haut risque. Quant aux agents pathogènes, parasites ou compagnons de route, ils présentent également un risque moyen. Toutefois, en raison du peu d’information disponible au sujet de nombreux agents pathogènes, parasites ou compagnons de route associés à cette espèce de crabe, à l’exception d’une douve du poumon qui pourrait toucher les êtres humains, il subsiste une grande incertitude relativement aux organismes associés possibles.

D'AMOURS, O., P. ARCHAMBAULT, C.W. McKINDSEY, L.E. JOHNSON, 2008. Local enhancement of epibenthic macrofauna by aquaculture activities. Mar. Ecol. Prog. Ser., 371: 73-84.

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Bivalve aquaculture can influence coastal marine ecosystems by increasing organic material deposition, which, in turn, can have multiple direct and indirect effects on the surrounding benthic community. We assessed the influence of blue mussel Mytilus edulis aquaculture on the epibenthic macrofauna at 4 sites in Prince Edward Island, eastern Canada. The abundance of macroinvertebrates and benthic fishes (>2 cm) was evaluated by visual counts using SCUBA within 4 mussel aquaculture facilities (‘farms’) and at locations at distances of 50, 100, 500 and 2000 m outside of them in June, August and November 2005. Benthic assemblages were dominated by seastars Asterias sp. (79 %), rock crabs Cancer irroratus (8 %), mud crabs Neopanope sayi (6 %), moon snails Lunatia heros (2 %), winter flounders Pleuronectes americanus (2 %), American lobsters Homarus americanus (1 %) and hermit crabs Pagarus sp. (1 %). Although there was great variability among sites and sampling dates, mussel aquaculture had a clear effect on total abundance, which was generally greater within farms than at distances outside of them. These increases in abundance were mainly associated with increased numbers of seastars and rock crabs. Taxonomic richness and evenness differed among some mussel farms and distances outside of mussel farms, but there were no clear trends that suggested a negative influence of mussel aquaculture. Multivariate analyses indicated that communities within mussel farms differed from those at corresponding communities at distances outside of farms, but that the taxa that contributed to these differences varied among farms. Taxonomic assemblages for a specific farm and date were generally similar among distances outside of farms and increases in the abundance of epibenthic macrofauna appeared to be largely restricted to the immediate vicinity of mussel farms, i.e. <50 m. This increase in abundance probably reflected the attraction of mobile fauna due to increased food supply and possibly to the creation of a more heterogeneous habitat. These results suggest that large macroinvertebrates and benthic fishes, including ecologically and commercially important species, seem to respond positively to the presence of suspended mussel culture.©2008 Inter-Research

CLYNICK, B.G., C.W. McKINDSEY, P. ARCHAMBAULT, 2008. Distribution and productivity of fish and macroinvertebrates in mussel aquaculture sites in the Magdalen islands (Que´bec, Canada). Aquaculture, 283: 203-210.

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Aquaculture structures may function in a manner analogous to artificial reefs, in that they provide a complex three-dimensional habitat for marine organisms and/or modify the surrounding environment. Further, aquaculture structures may increase the productivity of fish and macroinvertebrates similarly to natural complex habitats, such as seagrass beds. This research tested the general hypothesis that suspended bivalve culture increases the abundance and productivity of fish and macroinvertebrates. The study was done at two mussel farms in the Magdalen Islands, eastern Canada. Fish and macroinvertebrates were sampled in different areas within farms sites and in adjacent natural vegetated and unvegetated habitats. The instantaneous growth rates of winter flounder (Pseudopleuronectes americanus), sand shrimp (Crangon septemspinosa) and the rock crab (Cancer irroratus) were estimated using physiological indicators (RNA/DNA ratios). The results demonstrated that mussel sites are not equivalent to natural structurally complex seagrass beds with respect to fish and macroinvertebrate assemblages. Several species were abundant in mussel farms, including winter flounder and rock crab. This work, however, provided little evidence to suggest that there was greater productivity of these fish and macroinvertebrates at mussel farms, as growth rates were usually equivalent in different habitats. This study, to our knowledge, is the first attempt to determine changes in productivity brought about by aquaculture. As future development of mussel aquaculture increases in many regions around the world, the methods presented here will provide baseline information on the abundance and productivity of fish and macroinvertebrates associated with aquaculture sites.©2008 Elsevier B.V.

D'AMOURS, O., P. ARCHAMBAULT, C.W. MCKINDSEY, L. ROBICHAUD, 2008. The influence of bivalve aquaculture on ecosystem productivity. World Aquacult., 39(3) : 26-31.

DROUIN, A., C.W. McKINDSEY, 2007. QBRAT v2 assessment : Codium fragile ssp. tomentosoides in the Gulf of St. Lawrence as a case study ; Evaluation de QBRAT v2 : etude de cas pour Codium fragile ssp. tomentosoides dans le golfe du Saint-Laurent. DFO, Canadian Science Advisory Secretariat, Research Document ; MPO, Secrétariat canadien de consultation scientifique, Document de recherche, 2007/007, 28 p.

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La macroalgue verte Codium fragile ssp. tomentosoides (appelée ci-après Codium) provient du Japon et a envahi les eaux de l’est du Canada. La présente étude évalue le risque associé à la propagation de Codium fragile ssp. tomentosoides dans le golfe du Saint-Laurent. Plusieurs objectifs spécifiques ont été par le fait même examinés : 1) procéder à un examen et à une synthèse de la littérature disponible sur l’écologie et les impacts de Codium; 2) solliciter, dans le cadre d’une enquête, l’avis d’experts de cette espèce en ce qui concerne les vecteurs de dispersion, les attributs de son habitat essentiel ainsi que les probabilités et l’importance des impacts environnementaux, économiques et sociaux associés à l’établissement de Codium; 3) évaluer l’utilité de la méthode de hiérarchie multicritère (MHM) pour interpréter l’avis des experts; 4) évaluer le risque posé par Codium dans le golfe du Saint-Laurent; 5) évaluer l’utilité de l’outil d’évaluation du risque quantitatif (QBRAT v2) (cadre et logiciel) en utilisant l’évaluation du risque lié à Codium en tant qu’étude de cas. L’analyse qualitative de l’examen de la littérature et les résultats de l’enquête laissent sous-entendre que Codium poursuivra fort probablement son expansion dans le golfe du Saint-Laurent et devrait causer des dommages à divers composants. La propagation par des thalles ou des fragments de thalles est considérée comme le plus grand vecteur pour la propagation de Codium. En ce qui concerne les processus naturels, la propagation au moyen de propagules est considérée beaucoup moins importante. Selon les experts, le plus important vecteur anthropique lié à la propagation de Codium est la translocation d’objets infestés. La présence de structures artificielles et l’encrassement biologique des navires sont considérés comme étant le deuxième plus important vecteur anthropique, tandis que la navigation de plaisance et commerciale ainsi que les eaux de ballast sont considérées comme moins importants. Les plus importants critères associés à l’adéquation de l’habitat sont les facteurs associés avec la qualité du substrat (exposition aux vagues, aire d’habitat disponible et type de substrat) et la température moyenne de l’eau. Les experts semblent également croire que deux des quatre critères environnementaux (biodiversité et interactions trophiques) seraient très exposés à une invasion de Codium. Les critères économiques sont considérés comme étant à risque modéré et les critères sociaux, à risque modéré ou négligeable. La MHM nous a permis assez efficacement de résumer l’opinion des experts et de décrire l’erreur associée à l’évaluation de chaque critère. Cette méthode nous a donc permis d’effectuer une organisation quantitative des données qualitatives. L’évaluation du risque effectuée à l’aide du cadre QBRAT a démontré que le golfe du Saint-Laurent était exposé à un risque élevé d’invasion par Codium et que la majeure partie de ce risque était associée à la poursuite de la propagation de l’algue dans la région. On devrait utiliser de nouveau QBRAT avec Codium pour évaluer séparément les critères écologiques, économiques et sociaux afin de fournir aux gestionnaires l’information la plus précise. L’utilisation de QBRAT v2 a permis à des utilisateurs novices d’orienter leurs recherches pour acquérir toute l’information nécessaire à l’exécution de l’évaluation du risque et procéder à des choix plus objectifs. L’utilisation de la MHM combinée avec QBRAT v2 a permis aux utilisateurs de bien définir les valeurs associées à différents critères ainsi que la structure d’erreur connexe. Plusieurs recommandations spécifiques à QBRAT sont formulées.

SIMARD, N., N. PAILLE, C.W. McKINDSEY, 2007. Codium fragile ssp. tomentosoides : revue de litterature et situation aux Iles-de-la-Madeleine. Rapp. manus. can. sci. halieut. aquat., 2786, 40 p.

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Ce document présente une revue des connaissances sur les caractéristiques et la biologie de cette algue qui s’applique à la côte est de l’Amérique du Nord et au sud du golfe Saint-Laurent. Un aperçu des impacts écologiques et économiques observés ailleurs dans le monde et des tentatives de contrôle est également présenté. Codium fragile ssp. tomentosoides a été observé aux Îles-de-la-Madeleine pour la première fois en 2003. Un programme d’échantillonnage exploratoire a été réalisé en 2004 et 2005 afin d’évaluer la situation de cette espèce dans cette région. Les résultats démontrent que C. fragile ssp. tomentosoides s’est établi dans la région du havre de la Grande Entrée, particulièrement dans la baie Old Harry et à l’embouchure de la baie de la Grosse Île où des densités importantes ont été répertoriées. Les conditions environnementales des Îles-de-la-Madeleine pourraient donc être propices à une invasion par cette algue. Les conséquences écologiques de l’arrivée de C. fragile ssp. tomentosoides sur les communautés indigènes des Îles-de-la-Madeleine sont encore inconnues à ce jour. Un meilleur contrôle des vecteurs potentiels d’introduction et de dispersion et la mise sur pied d’un programme de suivi et de recherche sont des actions nécessaires pour limiter les risques de dispersion et mieux comprendre les conséquences écologiques et économiques inhérentes à la présence de cet envahisseur.

RICHARD, M., P. ARCHAMBAULT, G. THOUZEAU, C.W. McKINDSEY, G. DESROSIERS, 2007. Influence of suspended scallop cages and mussel lines on pelagic and benthic biogeochemical fluxes in Havre-aux-Maisons Lagoon, I^les-de-la- Madeleine (Quebec, Canada). Can. J. Fish. Aquat. Sci., 64: 1491-1505.

Une série d’expériences in situ a été réalisée en juillet 2004 afin de tester et de comparer l’influence de cultures de bivalves en suspension (moules (Mytilus edulis) de 1 an et de 2 ans et pétoncles (Placopecten magellanicus)) sur les flux biogéochimiques dans la colonne d’eau et à l’interface eau-sédiment dans la lagune du Havre-aux-Maisons (Québec, Canada). Les structures aquacoles augmentent la biomasse de la macrofaune pélagique (PMB) et agissent comme un puits d’oxygène et une source de nutriments dans la colonne d’eau en condition d’obscurité. Bien que la PMB soit plus faible au niveau de la pectiniculture, l’influence des paniers de pétoncles sur les flux pélagiques est similaire, voire supérieure (nitrates et nitrites), à celle des filières de moules. Au contraire de la pectiniculture, les cultures de moules enrichissent le sédiment en matière organique et diminuent l’abondance des organismes benthiques par comparaison aux zones témoins. Cependant, la demande benthique en oxygène ne varie pas entre les différentes zones de culture et les zones témoins. Les flux benthiques de sels nutritifs atteignent un maximum sous les structures aquacoles. L’interface benthique et l’interface pélagique modifient potentiellement les stocks d’oxygène et de sels nutritifs dans les zones de cultures de la lagune du la lagune du Havre-aux-Maisons. La contribution des structures aquacoles aux stocks d’oxygène, d’ammonium et de phosphates pourrait dépendre de la PMB et du type des bivalves en culture. Alors que les structures aquacoles jouent un rôle important dans le cycle des nitrates et des nitrites, le cycle du silicium est régi principalement par la minéralisation benthique des biodépôts.©2007 NRC Canada

McKINDSEY, C.W., T. LANDRY, F.X. O'BEIRN, I.M. DAVIES, 2007. Bivalve aquaculture and exotic species : a review of ecological considerations and management issues. J. Shellfish Res., 26(2): 281-294.

[Résumé disponible seulement en anglais]
Bivalves have been grown and transported for culture for hundreds of years and the introduction of some species outside of their native range for aquaculture has been suggested to be one of the greatest modes of introduction of exotic marine species. However, there has yet to be a thorough assessment of the importance of aquaculture and bivalve culture in particular, to the introduction and spread of exotic species. This paper reviews some of the environmental and ecological implications of the relationship between bivalve aquaculture and the introduction and spread of exotic species, management implications and mitigation strategies. Two broad classes of introductions of exotic species may result from activities associated with bivalve aquaculture. First, the intentional introduction of exotic species into an area for aquaculture purposes, i.e. the "target" species. These are typically foundation or engineering species and may have a considerable influence on receiving ecosystems. Second, the introduction of species that are either associated with introduced bivalves or facilitated by aquaculture activities (i.e. structures or husbandry practices). These may include both "hitchhiking" species (organisms that grow in association with or may be transferred with cultured bivalves) and disease causing organisms. Management options should include the use of risk assessments prior to transfers and quarantines. Various types of mitigation for exotic species have been evaluated but are generally not very successful. Because the risk of exotic species to ecosystems and the bivalve farming industry itself may be great, effort should be directed to better predict and halt introductions of potentially harmful species.© 2007 National Shellfisheries Association

CALLIER, M.D., C.W. McKINDSEY, G. DESROSIERS, 2007. Multi-scale spatial variations in benthic sediment geochemistry and macrofaunal communities under a suspended mussel culture. Mar. Ecol. Prog. Ser., 348: 103-115.

[Résumé disponible seulement en anglais]
The chemical and biological effects of biodeposition from a mussel culture were evaluated at multiple spatial scales during the summer of 2003 in Great-Entry Lagoon, eastern Canada. Sediment samples were collected directly under and between mussel lines (positions 10 m apart: 10 m scale) from multiple sites (located ca. 100 m apart: 100 m scale) in each of 3 zones: reference ®, 0+ and 1+ mussel cohort zones (located at least 500 m apart: km scale). In general, redox potential decreased and sulphide concentration increased with sediment depth but did not differ among zones or positions. A clear difference in macrofaunal community structure was observed among R, 0+ and 1+ zones, as well as between the positions directly under mussel lines in 1+ sites (1+ _under) and those between 1+ mussel lines (1+_between). The benthic community at 1+_under positions was dominated by an opportunistic species (Capitella capitata) and had the lowest diversity and biomass. 0+ sites were characterised by the greatest number of species and biomass, suggesting that some species have benefited from a moderate organic loading from the 0+ mussels. Historical data indicate that the deeper part of the lagoon was a naturally enriched environment. The mussel farm probably contributes to local organic enrichment. Comparison of benthic communities from the present study (>20 yr after the initiation of mussel aquaculture) in the site to similar historical data from 3 periods (1975 and 1978, before mussel farming; 1982, at the start of farming activities; and 2004, after the 1+ mussel harvest) showed that community structure differed largely because of the greater abundance of deposit feeders in 2003. However, among these 3 periods the differences in benthic community structure were no greater than differences observed between years within the periods.©2007 Inter-Research

McKINDSEY, C.W., H. THETMEYER, T. LANDRY, W. SILVERT, 2006. Review of recent carrying capacity models for bivalve culture and recommendations for research and management. Aquaculture, 261: 451-462.

[Résumé disponible seulement en anglais]
Models and tools for assessing the carrying capacity of an area of interest for bivalve culture can be classified according to their level of complexity and scope. In this report, we discuss and outline four hierarchical categories of carrying capacity studies: physical, production, ecological, and social carrying capacity. The assessment of carrying capacity for progressively higher categories of models is based on a sound understanding of preceding categories. We discuss each in brief and the third in more detail as this is the level at which knowledge is the most lacking and for which science may make the most advances. (1) Physical carrying capacity may be assessed by a combination of hydrodynamic models and physical information, ideally presented and analysed within a Geographic Information System (GIS). (2) Most scientific effort to date has been directed towards modelling production carrying capacity and some of the resulting models have been used successfully to this end. Further development of these models should pay attention to (i) better modelling of feedback mechanisms between bivalve culture and the environment, (ii) a consideration of all steps in the culture process (seed collection, ongrowing, harvesting, and processing), and (iii) culture technique. (3) The modelling of <i<ecological carrying capacity is still in its infancy. The shortcomings mentioned for models for production carrying capacity estimates are even greater for ecological carrying capacity models. GIS may be employed to consider interactions between culture activities and sensitive habitats. (4) It is recommended that social carrying capacity be evaluated only after the preceding levels have been completed so that an unbiased assessment is obtained. This however does not exclude direction from managers for scientists as to which factors (such as water clarity, specific habitats, etc.) should be evaluated. The use of expert systems to aid in management decisions is briefly discussed with a suggested application of a fuzzy expert system to this end.© 2006 Elsevier B.V.

CALLIER, M.D., A.M. WEISE, C.W. McKINDSEY, G. DESROSIERS, 2006. Sedimentation rates in a suspended mussel farm (Great-Entry Lagoon, Canada): biodeposit production and dispersion. Mar. Ecol. Prog. Ser., 322: 129-141.

[Résumé disponible seulement en anglais]
Experimental and field studies were carried out to characterise biodeposit dynamics in a suspended mussel Mytilus edulis L. farm in Great-Entry Lagoon, eastern Canada. We assessed: (1) the quantity and quality of biodeposits produced by different age classes of mussels, (2) the size-dependent sinking velocity of faeces and (3) the variation in sedimentation rates at different spatial and temporal scales. Individual 0+ mussels produced on average only 63 % of the mass of biodeposits (32.4 mg dry wt d^-1 ind.^-1 that 1+ mussels did (51.5 mg dry wt d^-1 ind.^-1. In contrast, the amount of biodeposits produced per unit body weight (dry weight of soft tissue) was greater for 0+ than for 1+ mussels. Faecal pellet sinking velocity ranged from 0.27 to 1.81 cm s^-1 for mussels ranging in size from 3 to 7 cm, and was best correlated with faecal pellet width. Sedimentation rates were greater within the farm than at reference sites, supporting the hypothesis that mussel farming increases sedimentation rates. Variations in sedimentation were also observed at small spatial scales and through time. Prior to the harvesting of 1+ mussels, sedimentation rates directly under the 1+ mussel lines were about twice those 10 m distant, between the lines, and in other zones (reference sites and sites in the lease with 0+ mussels). These observations and sedimentation patterns along transects leading away from the mussel farm suggest that biodeposits from the farm are not dispersed broadly. The estimated initial dispersal of faecal pellets ranges from 0-7.4 m (1+ mussels) to 7-24.4 m (0+ mussels).©2006 Inter-Research

LANDRY T., M. SKINNER, A. LEBLANC, D. BOURQUE, C.W. McKINDSEY, R. TREMBLAY, P. ARCHAMBAULT, L. COMEAU, S. COURTENAY, F. HARTOG, M. OUELLETTE, J.-M. SÉVIGNY, 2006. A scientific review of bivalve aquaculture : interaction between wild and cultured species. Pages 80-138 in A scientific review of the potential environmental effects of aquaculture in aquatic ecosystems. Dept. of Fisheries and Oceans (Can. Tech. Rep. Fish. Aquat. Sci., 2450(5)).

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Cet article porte sur l’examen de l’état actuel des connaissances sur les interactions entre les espèces d’élevage et les espèces sauvages dans le contexte de l’élevage de bivalves en milieu marin au Canada. De plus, nous y cernons les lacunes dans les connaissances qui ont une importance particulière et nous recommandons des projets de recherche pour combler ces lacunes. Nous avons passé en revue les ouvrages canadiens et étrangers contenant de l’information sur l’élevage, le rétablissement, les communautés côtières et l’écologie des bivalves. Le présent examen est axé sur les changements qui ont une incidence sur la communauté pélagique, les communautés benthiques, les prédateurs, les structures génétiques et le risque d’introduction d’espèces envahissantes.

ANDERSON, M.R., P.J. CRANFORD, C.W. McKINDSEY, P. STRAIN, B.T. HARGRAVE, W.K.W. LI, W.G. HARRISON, 2006. Cumulative and far-field fish habitat effects ; Effets cumulatifs et a tres grande distance sur l'habitat du poisson. DFO, Canadian Science Advisory Secretariat, Research Document ; MPO, Secrétariat canadien de consultation scientifique, Document de recherche, 2006/037, 30 p.

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McKINDSEY, C.W., M.R. ANDERSON, P. BARNES, S. COURTENAY, T. LANDRY, M. SKINNER, 2006. Effects of shellfish aquaculture on fish habitat ; Effets de la conchyliculture sur l'habitat du poisson. DFO, Canadian Science Advisory Secretariat, Research Document ; MPO, Secrétariat canadien de consultation scientifique, Document de recherche, 2006/011, 92 p.

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McKINDSEY, C.W., 2006. La mariculture peut-elle augmenter la productivité des écosystèmes ?. Naturaliste can., 130(1): 69-73.

SIMARD, N., C.W. McKINDSEY, P. ARCHAMBAULT, C. CYR, 2005. Découverte d'espèces marines envahissantes aux îles de la Madeleine. Naturaliste can., 129(2): 62-64.

McKINDSEY, C., 2004. Aquaculture et l'habitat du poisson: impacts négatifs ou positifs d'un point de vue de l'écosystème. Vect. Environ., 37(6): 26-27.

GENDRON, L., A.M. WEISE, M. FRECHETTE, P. OUELLET, C.W. McKINDSEY, L. GIRARD, 2003. Evaluation of the potential of cultured mussels (Mytilus edulis) to ingest state I lobster (Homarus americanus) larvae. Can. Ind. Rep. Fish. Aquat. Sci., 274, 20 p.

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Au Québec, la mytiliculture est en plein essor et se développe présentement dans des secteurs ou le homard est présent et ou il est probable de retrouver des larves de homard. Les pêcheurs de homard s'interrogent à savoir si la mytiliculture peut représenter un danger pour les larves de homard. Ils évoquent la possibilité que les moules puissent ingérer les larves de homard et causer leur mort. L'objectif de ce projet était d'évaluer si les larves de homard (Homarus americanus) de stade I sont capturées par les moules d'élevage (Mytilus edulis) lorsque places ensemble et de déterminer, le cas échéant, si cette ingestion pouvait tuer ou blesser la larve.

GENDRON, L., A.M. WEISE, M. FRECHETTE, P. OUELLET, C.W. McKINDSEY, L. GIRARD, 2003. Évaluation du potentiel des moules d’élevage (Mytilus edulis) à ingérer des larves de homard (Homarus americanus) de stade I. Rapp. can. ind. sci. halieut. aquat., 274, 20 p.

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Au Québec, la mytiliculture est en plein essor et se développe présentement dans des secteurs ou le homard est présent et ou il est probable de retrouver des larves de homard. Les pêcheurs de homard s'interrogent à savoir si la mytiliculture peut représenter un danger pour les larves de homard. Ils évoquent la possibilité que les moules puissent ingérer les larves de homard et causer leur mort. L'objectif de ce projet était d'évaluer si les larves de homard (Homarus americanus) de stade I sont capturées par les moules d'élevage (Mytilus edulis) lorsque places ensemble et de déterminer, le cas échéant, si cette ingestion pouvait tuer ou blesser la larve.

McKINDSEY, C.W., E. BOURGET, 2001. Body size and spatial variation of community structure in subarctic intertidal boulder fields. Mar. Ecol. Prog. Ser., 216: 17-30.

McKINDSEY C.W., E. BOURGET, 2001. Diversity of a northern rocky intertidal community : the influence of body size and succession. Ecology, 82(12): 3462-3478.

McKINDSEY, C.W., E. BOURGET, 2000. Explaining mesoscale variation in interdidal mussel community structure. Mar. Ecol. Prog. Ser., 205 : 155-170 .